Una vez bajo custodia del Tribunal de la Casa Imperial, Isabel comprendió que su embarazo no le había valido el perdón.
Al final perdió al hijo que esperaba. El médico imperial atribuyó la pérdida al miedo y la angustia.
En consideración a los servicios de la familia Villegas, el emperador no la condenó a muerte, pero ordenó que permaneciera encerrada de por vida en una residencia apartada.
Juana, el encargado de la botica y quienes habían participado en la falsa fuga recibieron el castigo corre